Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms