Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms