Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms