Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB9BQ9NP90 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms