Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSPNQ9HAW4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms