Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms