Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms