Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms