Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ROPN1BQ9BZX4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms