Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM8Q9BZR9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM8Q9BZR9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms