Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms