Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUS3Q9BZE2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms