Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PECRQ9BY49 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PECRQ9BY49 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms