Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms