Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms