Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms