Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD2Q9BTF0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms