Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GORASP1Q9BQQ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms