Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOL4Q9BPW4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms