Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms