Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms