Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAT1Q99536 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms