Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms