Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71F1Q96KD3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms