Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRF1Q92994 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRF1Q92994 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRF1Q92994 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRF1Q92994 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms