Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms