Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms