Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3LQ8TDB6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms