Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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