Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF439Q8NDP4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF439Q8NDP4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF439Q8NDP4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF439Q8NDP4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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