Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf163Q8N9P6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms