Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZIC4Q8N9L1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms