Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms