Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms