Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC24Q8N4L8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms