Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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LRRC18Q8N456 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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LRRC18Q8N456 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC18Q8N456 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms