Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP13Q86W25 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms