Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLNKQ7Z7G1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms