Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms