Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS6Q7L5N1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS6Q7L5N1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms