Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms