Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms