Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms