Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms