Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC27A4Q6P1M0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms