Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms