Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIRMAQ69YN4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIRMAQ69YN4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms