Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF6Q5VXH4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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