Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SAMD13Q5VXD3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SAMD13Q5VXD3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SAMD13Q5VXD3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SAMD13Q5VXD3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SAMD13Q5VXD3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SAMD13Q5VXD3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SAMD13Q5VXD3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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