Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01545Q5VT33 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01545Q5VT33 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms